RDKit | 基于R基团分解(R-group decomposition)高亮分子

网友投稿 1056 2025-03-31

一组共享一个共同骨架的分子上做R基分解(RGD,R-group decomposition),为那些对准骨架的分子生成坐标,并生成分子图像,其中的R基团被涂上了颜色,使它们容易被挑选出来

注:RDKit版本≥2020.09.1

导入

import rdkit

from rdkit import Chem

from rdkit.Chem import Draw

from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole

IPythonConsole.molSize=(450,350)

from rdkit.Chem import rdRGroupDecomposition

from rdkit.Chem import rdqueries

from rdkit.Chem import rdDepictor

from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D

RDKit | 基于R基团分解(R-group decomposition)高亮分子

from rdkit import Geometry

rdDepictor.SetPreferCoordGen(True)

import pandas as pd

from IPython.display import SVG,Image

from ipywidgets import interact

print(rdkit.__version__)

2020.09.1

版权声明:本文内容由网络用户投稿,版权归原作者所有,本站不拥有其著作权,亦不承担相应法律责任。如果您发现本站中有涉嫌抄袭或描述失实的内容,请联系我们jiasou666@gmail.com 处理,核实后本网站将在24小时内删除侵权内容。

版权声明:本文内容由网络用户投稿,版权归原作者所有,本站不拥有其著作权,亦不承担相应法律责任。如果您发现本站中有涉嫌抄袭或描述失实的内容,请联系我们jiasou666@gmail.com 处理,核实后本网站将在24小时内删除侵权内容。

上一篇:如何在Excel中以无/下划线/破折号/逗号替换空白?
下一篇:条件格式(条件格式工具在哪里)
相关文章